A história segue um cânon e continuidade separado de quaisquer mídia do Sonic the Hedgehog. No passado a Rainha Aleena, antiga governadora de Móbius foi conspirada a perder seu trono quando o maléfico Robotnik a ameaçou de dominar seu posto com seu exército de máquinas e robotizadores transformando o mundo em um lugar caótico e sombrio coberto sobre a tecnologia. Antes disso tudo acontecer, Aleena recebeu uma profecia direta do Oráculo de Delphius, que a mandou se afastar de seus filhos (Sonic, Sônia e Manic) os abandonando em três lares, e em seguida fugir para que um dia futuramente reencontrar os filhos já amadurecidos e unirem forças formando o “Conselho dos Quatro”, para juntos derrotarem Robotnik e trazer a liberdade para Móbius outra vez.
Muitos anos depois os três crescem em diferentes formas de vida e costumes, Sônia se torna uma dama rica em meio a aristocracia, Manic cresce como um criminoso nas ruas, e Sonic cresce com uma família humilde, até um dia Sonic receber um chamado do Oráculo e seu Tio Chuck, para que ele uni-se forças com Sônia e Manic e assim dar início a sua jornada, depois de terem seus lares e famílias perdidos no primeiro ataque de Robotnik. O Oráculo convoca três poderosos medalhões para os irmãos, com poderes de invocar instrumentos de rock mágicos para lutarem.
Desde então o trio forma a banda de heróis roqueiros “Sonic Underground”, sendo liderados por Sonic e viajando ao redor de Móbius em busca de se reencontrarem novamente com a mãe Aleena, ao mesmo tempo que entre cada destino fazem missões ajudando os habitantes de Móbius a escaparem dos ataques e planos de Robotnik e seus capangas Sleet e Dingo, que querem capturá-los e robotizá-los. |